En 1906, Añatuya era apenas un puñado de familias dando origen a un pueblo, pero con la pretensión de progresar de la mano de la educación, veía nacer su primera escuela y la única en varios kilómetros a la redonda, en este lugar del Chaco Santiagueño, inmensa extensión de territorio aun virgen en ese momento que ofrecía generosa la madera de sus bosques de quebrachos para construir las vías férreas que se extendían por el dilatado país como símbolo de progreso.

Era entonces la escuela el único nexo entre estado y poblador y la herramienta de consolidación del sentimiento patrio, que muchos de los recién llegados al país recién comenzaban a desarrollar y  transmitir a sus hijos, que eran la primera generación de argentinos de aquellos que llegaron de tan distantes lugares.

Rápidamente el ferrocarril se convirtió en el eje vertebrador de este poblado, generando rápidamente progreso económico que hacia crecer el poblado, pero que ansiaba el establecimiento de una escuela que fuera la guía de sus hijos y los preparara de mejor manera para seguir fortaleciendo el fruto del trabajo de los sacrificados primeros pobladores.

El día 11 de Mayo de 1906 se creó la primera escuela pública de Añatuya con el nombre de "Florentino Ameghino", que inició su ciclo primario bajo la dirección del Maestro Normal Mariano Maldonado, quién tuvo como ayudante a la Sra. Agustina L. de Vidarte y que funcionara en un local particular propiedad del Sr. Manuel Álvarez, siendo costeado el alquiler por la Comisión Municipal que presidía el Sr. Ernesto Abregú.

Su inscripción inicial fue de 105, los que pronto aumentaron en número, hasta que el 17 de Agosto de 1909 se inauguró su local propio. 

La escuela mantuvo la categoría de Infantil desde 1906 hasta 1913, hasta que en el año 1914 pasó a ser Escuela Elemental hasta 1918, fecha en que se constituyó en Superior, contando ya con doce grados y dictándose clases de enseñanza especial en las ramas de labores, música, Trabajo manual y economía doméstica. Poseía además una biblioteca provista de gran cantidad de volúmenes.

El crecimiento de esta institución jamás se detuvo y el día 4 de Mayo de 1951 se crea el "Jardines de Infantes" siendo su primera maestra jardinera la Sra. Argentina Banegas de Palavecino con una inscripción de 53 alumnos.

A partir de 1970 la escuela se convirtió en "Centro Experimental", contando en ese momento con 229 alumnos. 

La Escuela Florentino Ameghino se convirtió en la casa de estudios más importante del Chaco Santiagueño, ya que dio origen al colegio secundario Florentino Ameghino y fue cuna del Profesorado Elemental y el Profesorado Superior.

La escuela que hoy cumple 116 años, es la de mayor reconocimiento en la ciudad y su trayectoria sigue siendo la de marcar los rumbos de la educación publica en toda la zona, lo que se acredita con su dilatada trayectoria y frutos brindados.

•    1906 Escuela Infantil.

•    1914 Escuela Elemental.

•    1918 Escuela Superior.

•    .1938 Creación de los Cursos Normales.

•    1941 Escuela Normal de Maestros.

•    1951 Creación de los Jardines de Infantes.

•    1970 Centro Experimental.

•    1971 Instituto Superior de Formación Docente.

•    1981 Profesorado Superior en Geografía y Ciencias Biológicas.

Hoy, el Centro Experimental cuenta con una población que supera largamente los 800 alumnos, en 28 secciones y además de un plantel docente y de maestranza, cuenta con la invalorable colaboración de una cooperadora escolar, inscripta en cooperativismo escolar del consejo general de educación, que brinda apoyo y acompañamiento a las actividades escolares, que no solo se evidencian en el diario dictado de clases, sino en la inserción social que tiene esta institución en toda la ciudad.

El comienzo del año 2022 encuentra a este centro educativo en plena remodelación de su edificio, que ofrecerá una vez terminado, un edificio de vanguardia y pensado en las necesidades de los nuevos rumbos que necesita el sistema educativo.